Rektoskopi blir utført av lege.
Du blir satt i ein gynekologstol og legen fører skopet innover i endetarmen, og eventuelt i nedre del av tjukktarmen. For å få til dette, blåser legen inn litt luft via ein ballong som er festa til skopet, tarmen utvidar seg foran skopet, og det blir lettare å føre det innover.
Under uttrekkinga av rektoskopet inspiserer legen slimhinna grundig, gjerne med sirkulerande bevegelsar for å sikre seg at han får inspisert heile omkretsen av tarmhulen. Ofte blir det blåst inn luft for å gi betre oversikt. Dette kan nokre oppleve som litt ubehageleg fordi det kan sprenge litt på. Ved påvising av forandringar kan legen ta vevsprøver med ei biopsitang.